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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
吉林新年“绿意盎然”：冬季农博会展示中外农业风情******
(新春走基层)吉林新年“绿意盎然”：冬季农博会展示中外农业风情
中新网长春1月12日电 (谭伟旗)12日的长春农博园热闹非凡，园内的特色植物、珍稀动物各具风采。置身其中，让人仿佛忘记了此刻正是中国北方的寒冬时节。
第十三届吉林(长春)冬季农业博览会当天开幕，20万平方米的展示区域，安排了设施农业、观光农业、农业科技成果转化、新春年货展销等展区，既具科技感，又“年味儿”十足。
长春农博园内的植物景观 谭伟旗 摄作为中国的农业大省，吉林在设施农业发展方面不断取得新突破。长春农博园6万平方米的连栋智能温室里，重点展示了高新无土栽培、规模化无土栽培、基质栽培技术、热带果树园、鲜切花卉园、沙漠植物园、植物工厂等特色农业技术和成果。
室外，两栋不加温温室展示了北方冬季温室不供暖进行叶菜及果蔬生产，高效节能环保，成为北方现代农业模板。
长春农博园内展示的无土栽培技术 谭伟旗 摄世界农业风情园一直都有着火热的人气。园内划分亚洲、欧洲、美洲、非洲、大洋洲等五大洲农业风情区域，共推出300多种极具代表性的特色植物，形象生动地呈现了世界各地风格迥异的农业文明。
植物之外，珍禽园里的孔雀、鹦鹉等40多种动物也都极具观赏性；各类淡水鱼、海水鱼、观赏鱼、水母及趣味海洋动物在渔业展馆内尽情畅游。
长春市政府副秘书长孟宪新表示，由长春市政府主办的吉林(长春)冬季农博会，已成功举办了十二届，以其独特的魅力和展示形式，丰富了广大市民和农民群众春节期间的文化生活，成为吉林长春冬季冰雪旅游和冰雪文化的重要品牌。
孟宪新介绍，本届展会集农业品牌展示、现代农业观光、新春年货采购、节庆文化活动于一体，能够让更多的游客在浓郁的年味中领略北国春城的独特魅力，尽享长春现代农业发展带来的丰硕成果。(完)
（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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